A l'issue des échanges, le Nikkei des 225 valeurs vedettes a cédé 0,91% (-172,98 points) à 18.810,25 points.
L'indice élargi Topix de tous les titres du premier tableau a pour sa part reculé de 0,82% (-12,49 points) à 1.504,54 points.
Sur le volet des changes, le regain de la devise nippone a pesé sur les titres exportateurs nippons: le dollar s'est affaissé à 110,50 yens contre 111,47 yens lundi à la fermeture de la place tokyoïte, et l'euro à 117,80 yens, contre 118,95 yens.
Avant même l'attaque qui a fait 11 morts et 45 blessés en Russie, le yen s'était renforcé ces derniers jours, "alors que grandissent les doutes sur la capacité de l'administration Trump à faire avancer ses réformes", a commenté pour l'agence Bloomberg Kiyoshi Ishigane, chez Mitsubishi UFJ Kokusai Asset Management.
En outre, la tendance est à l'attentisme avant l'ouverture, imminente, de la saison des résultats d'entreprises au Japon et à l'étranger.
Plusieurs rendez-vous importants se profilent par ailleurs aux Etats-Unis: les minutes de de la dernière réunion de la Réserve fédérale américaine (Fed), le sommet entre le président américain Donald Trump et son homologue chinois Xi Jinping et les chiffres de l'emploi américain.
- Toshiba plonge encore -
Sur le front des valeurs, l'action du conglomérat industriel Toshiba a chuté de 9,37% à 206,8 yens mardi, au lendemain d'un recul de 5,5%. Elle a fondu de moitié depuis la révélation des déboires nucléaires du groupe fin décembre.
Après des informations similaires d'autres médias, le quotidien économique Nikkei a rapporté mardi que Toshiba pourrait repousser encore l'annonce de ses résultats financiers, "apparemment sur fond de désaccords avec un commissaire aux comptes aux Etats-Unis au sujet de l'enquête en cours sur des problèmes de gouvernance" au sein de sa filiale nucléaire américaine Westinghouse.
Il s'agirait le cas échéant du troisième délai, exposant le groupe à une radiation de la cote.
Le secteur automobile a également terminé dans le rouge, en raison de l'évolution défavorable des devises et surtout de ventes de voitures décevantes aux Etats-Unis pour le mois de mars: environ 1,56 million de véhicules ont été écoulés, soit une baisse de 1,6% sur un an, selon le cabinet Autodata.
Honda a ainsi lâché 2,65% à 3.262 yens, Nissan 2,89% à 1.040 yens, Mazda 3,09% à 1.532 yens, tandis que Toyota a fléchi de 1,02% à 5.984 yens.
Même tendance négative pour les deux poids lourds de la cote, l'opérateur de télécommunications SoftBank Group (-1,67% à 7.751 yens) et la firme d'habillement Fast Retailing (-1,59 % à 34.640 yens).
Du côté de l'électronique/technologies, Nintendo a été délaissé de la même manière (-2,61% à 26.055 yens), Panasonic a perdu 0,62% à 1.263 yens, mais Sony a augmenté de 0,27% à 3.674 yens.
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